顺应潮流:数血浆ctDNA-MRD检测的应用前景!

2022-01-24 06:09:28 来源:
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"酪氨酸被归入MRD扫描的商业意义是具体的,渴望这些进展将继续提很低下一代MRD扫描的精确性。"

肺癌的MRD扫描是一种嗅觉且特异的用作监控肺癌病人血液循环里面源性遗传物质(如ctDNA)相对量的作法。在这种状态下,病人无法肉眼可见的软组织,但显然实际上标准化药理学视觉作法无法扫描到但再一亦会导致肺癌中风的纤小软组织。

MRD,常称为纤小移去软组织(Minimal Residual Disease)。适用“Minimal” (纤小)这个该词,是因为它在史籍和药理学专家里面更加常以。不过,“Minimal”这个该词或许不具“误导性”,因为低水准的水肿在病因和疗程协调之外也或许不具不可忽视意义。“Measurable”(可探测)一该词可更加精确地说明了移去在产妇体外的骨髓的实际上。NCCN指南同时适用了“Minimal Residual Disease”(纤小移去软组织)和“Measurable Residual Disease”(可探测移去软组织)两个名词。

此外,可行性研究课题表明在小分子水准上扫描多种肺癌类型的ctDNA除此以外不具药理学效用,史籍和药理学专家有时也亦会适用“Molecular Residual Disease”(小分子移去软组织)一该词。

近些年来,国际间在也就是说里面基于ctDNA的MRD审核(ctDNA-MRD)的药理学数据资料和证据日渐多,开启了也就是说瘤MRD扫描的热潮。也就是说瘤ctDNA-MRD扫描的新的科技流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(知情比对)

对原发两的组织来进行测序以鉴定病人的特异性状两组人体内图说,然后外观设计模板定制panel或适用一般来说panel来进行个性化的ctDNA扫描比对。

2)Tumor-uninformed assays(知悉比对)

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即即可原发两的组织,大部分举例来说一两组预先选定模板/探针外观设计的与肺癌类型之外的一般来说panel来进行ctDNA扫描比对,常在扫描ctDNA等位性状的同时,先以ctDNA酪氨酸或相片两组学等多两组学作法。弥补了两的组织样本太少或监控核苷酸太少或TAT过长等问题。

Tumor-informed assays的新的科技方针更加相一致大众的认知,在保证很低酪氨酸的年前提下,可通过监控多核苷酸的sample-level(样本水准)进一步提很低其高频率,新的科技比率相对来说不是尤其很低。Tumor-uninformed assays的新的科技方针更加类似于早筛,通过提很低site-level(核苷酸水准)扫描高频率并先以ctDNA酪氨酸或相片两组学并珠合人工神经网络算法进一步提很低其高频率和酪氨酸,新的科技比率相对来说较很低。

2021年4年末29日,《Clinical Cancer Research》离线出版了“大部分适用血红素ctDNA扫描珠胃癌病人纤小移去软组织(MRD)”的社论,首次公开了Guardant Reveal的研究课题数据资料:MRD扫描高频率达到91%,酪氨酸达100%,这些推测赞同了大部分血红素ctDNA-MRD扫描(Tumor-uninformed assays)的潜在药理学运用。

2021年8年末13日,《Clinical Cancer Research》离线出版了“顺应潮流:大部分血红素ctDNA-MRD扫描的运用现状”的社论,在这里面的研究课题者们辩论审核了大部分血红素ctDNA扫描MRD的能力,以及将酪氨酸导入到ctDNA扫描的潜在好处。2

Parikh及其熟人1 和Taieb及其熟人3 辩论了大部分血红素ctDNA-MRD扫描在珠胃癌(CRC)病人里面的潜在药理学运用。

▲ ctDNA酪氨酸和等位性状在两项研究课题里面的运用比较(Parikh和Taieb)

珠胃癌(CRC)的疗程始终面临着一个挑战,即相当多的CRC病人因最初肺癌中风而则亦会死亡。尽管药理学改用了标准化的专门设计疗程,但很低风险IIIC期CRC病人的5年生存率也大部分有53%,毕竟是无法推测新的科技手段上未扫描到的纤小移去软组织(MRD)。4

现在,仍迫切必须精确考虑到哪些病人术后实际上MRD,以希望教导降低或缩减专门设计疗程,并缩减治愈的几率,同时最大限度地降低不致疗程的之外毒性。

在过去的几年里面的,我们对ctDNA在CRC诊断和病因里面的运用有了广泛应用的理解。现在,基于ctDNA的MRD审核正广泛应用运用作肺癌的疗程里面。

ctDNA是由DNA的短相片两组合成(大约130-150bp),由骨髓通过衰老、病变或表皮释放到循环系统里面。 ctDNA的锝略长导致其带入引人注意的实时负担研究课题课题,它的实际上或许反映了新的科技手段上好像的纤重新的分配。

在治愈性疗程珠束后,ctDNA里面显现借助于的生殖细胞等位性状对随后的新的科技手段中风不具较很低的特征性预测意义,尤其是当这些等位性状与开刀的两的组织里面的等位性状相匹配时。扫描这种ctDNA假定的MRD可以在I-III期CRC里面提年前新的科技手段数年末预测中风,从而为一两组再一亦会中风的CRC病人透过一个审核新的疗法的售票处。然而,这些ctDNA经济体制等位性状假定的MRD扫描作法的高频率始终是有限的,迫切必须改进其扫描精确性。

ctDNA的酪氨酸扫描相对于ctDNA的经济体制等位性状扫描。ctDNA的酪氨酸极度在CRC里面相当类似,并被看作大多数病变的最初过渡期。这种酪氨酸,就其假定为DNA里面胞嘧啶的C5位置添加甲基基团,调控不远处性状的表达,除此以外经典的惧转录失活。与经济体制等位性状相比之下,CRC里面实际上更加多的酪氨酸极度周边,为提很低MRD扫描的高频率透过了机亦会。SEPT9,就是第一个利用血液循环扫描单性状酪氨酸极度来进行年前列腺癌和最初扫描CRC的作法。尽管ctDNA酪氨酸有这些优点,但这些相同的特性也必须谨慎,以保持一致扫描比对的酪氨酸,并尽量降低假特征性的几率。

在这种氛围下,Parikh和Taieb的除此以外最近研究课题珠果为我们对ctDNA精确性的理解透过了感兴趣的必需,即即可原发两的组织,大部分通过血液循环ctDNA酪氨酸或联合ctDNA等位性状即可来进行精确的MRD审核。与其他必须对原发两的组织来进行测序以教导原先ctDNA比对的扫描不同,除此以外研究课题聚焦了Tumor-uninformed assays的实证,它有几个军事优势,除此以外慢速的TAT,降低初始成本,对两的组织太少或不可用的病人来进行监控。

Parikh等人透过了一种ctDNA酪氨酸珠合ctDNA经济体制等位性状的一般来说panel来进行MRD的比对审核(NGS作法),与其他商业化上可用的MRD扫描作法相比之下,这种作法不必须开刀的两的组织以及定制化。在再一疗程后适用时,这种大部分血红素ctDNA-MRD扫描对中风不具药理学意义的酪氨酸(100%)和高频率(55.6%),通过导入密切相关性状两组特点和两端监控比对,其高频率可进一步提很低至91%。1 该作法被用作早就来进行的年前瞻性研究课题,除此以外教导IIA期珠肠癌疗程协调的NRG密切合作两组研究课题(NCT04068103)。虽然还必须额外的数据资料集来实验者这些推测,但这些珠果证明了基于ctDNA的MRD扫描在知悉的意味著可给与的扫描精确性特点。

Taieb等人的研究课题利用了一对先年前被证明是CRC开刀后病因之外的酪氨酸性状标明物WIF1和NPY(ddPCR作法),并将它们运用作PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验,将III期CRC病人随机分为3个年末 vs 6个年末的专门设计化疗。在对举办III期试验的III期CRC病人来进行的首次ctDNA-MRD审核里面,有13.8%的病人术后为ctDNA-MRD特征性,并被确认为另行的病因研究课题课题。3 同时,研究课题者也指借助于,与其他改用NGS作法的ctDNA-MRD研究课题相比之下,本研究课题里面ctDNA的特征性率低。高频率和PPV除此以外小于NGS扫描珠果,ctDNA-MRD特征性和阴性的5年DFS分列65%和73%,尽管专门设计疗程的和不理想的年前比对样本处理或许亦会对这些珠果造成制约。该作法值得注意的是其相对单纯,相当低的成本和潜在的重现性,不必须商业化扫描里面所见的专利扫描作法。早就来进行的年前瞻性研究课题将进一步审核大部分血红素ctDNA扫描是否能够精确审核MRD,以便对CRC病人来进行风险分层,并教导专门设计疗程协调。

无论改用何种作法,大部分用血红素ctDNA-MRD扫描来教导CRC病人的疗程重新考虑,必须精确且精确的扫描作法。即可进一步提很低大部分血红素ctDNA-MRD扫描的高频率来考虑到哪些病人可以从疗程降级里面想得到,以避开不恰当地必即可很低危病人给与低数值的疗程。Parikh及其熟人的研究课题珠果表明,导入性状两组和密切相关性状两组以及两端血红素监控,可显著提很低大部分血红素ctDNA-MRD的高频率。相比之下之下,ctDNA-MRD扫描的很低酪氨酸对于ctDNA作为一个完整的生物研究课题课题来考虑到疗程强化是至关不可忽视的。由于酪氨酸太少,假特征性的ctDNA-MRD或许亦会使病人给与不致的强化疗程。Parikh及其熟人的研究课题珠果证明,除经济体制等位性状外,还可以通过珠合密切相关性状两组酪氨酸特点的比对来保持一致酪氨酸。Taieb等人的比对作法的军事优势在于提很低了药理学特点的高频率和病因,但是,正如研究课题者承认的那样,另行的两个性状酪氨酸标明或许无法透过与珠合经济体制等位性状作法的精确性特点。不可忽视的是,这项指导也强调了标准化化比对年前条件的效用,因为各种分离出来作法可以在很大往往上制约ctDNA的得率和完整性。在将来的研究课题里面,这些比对年前的考虑将变得日渐不可忽视。

酪氨酸被归入MRD扫描的商业意义是具体的,渴望这些进展将继续提很低下一代MRD扫描的精确性。总之,大部分血红素ctDNA-MRD的扫描透过了一个独特的机亦会,适用一种无创作法来聚焦疗程方案,并有或许根绝很低危病人的纤重新的分配性软组织。这些研究课题珠果无疑为将来ctDNA-MRD教导的年前瞻性药理学试验铺平了巷道。

MRD,始终是一个慢速蓬勃发展的领域,我们预计近两年或许亦会显现借助于新的的证据,要么推测借助于MRD扫描的药理学效用的局限性,要么推测借助于MRD扫描的其他军事优势和新的用途。

参考资料:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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